Karjerą jau baigusį plaukiką apkaltino jo buvusio trenerio Lionelio Horterio dukra, taip pat plaukikė Naome Horter.
Remiantis jos parodymais, santykiai su Y. Agneliu užsimezgė 2016-aisiais, kuomet šiam buvo 24-eri, o jai – 13 metų. Tituluotas atletas tuo metu gyveno trenerio namuose. Anot N. Horter, seksualinę prievartą ji patirdavo ir kitose vietose, kur kartu keliaudavo sportuoti – Tailande, Tenerifėje (Ispanija).
Kaltinimus išprievartavimu Y. Agnelis neigia tvirtindamas, kad sutikimas buvo abipusis. Tyrimą atlikusių prokurorų manymu, byloje surinkti įrodymai leidžia daryti išvadą, kad dėl amžiaus skirtumo plaukiko veiksmai kvalifikuotini kaip seksualinis užpuolimas ir išžaginimas.
Y. Agnelis ryškiausiai spindėjo 2012 metų Londono olimpinėse žaidynėse, kur surinko tris medalius. Laimėjęs 200 m plaukimo laisvu stiliumi rungtį, jis su tautiečiais analogiškai pasižymėjo ir estafetėje 4x100 m, pelnė sidabrą 4x200 m.
Prancūzas vėl buvo nepralenkiamas 2013-ųjų pasaulio čempionate, tačiau vėliau ėmė prarasti pozicijas ir karjerą baigė po 2016-ųjų Rio de Žaneiro žaidynių.
Visų laikų greičiausių plaukikų rikiuotėje 200 m nuotolyje Y. Agnelis nusileidžia tik pasaulio rekordininkui iš Vokietijos Pauliui Biedermannui, JAV legendai Michaelui Phelpsui ir rumunui Davidui Popovici. O, pavyzdžiui, šioje rungtyje besispecializuojantį Daną Rapšį nuo prancūzo skiria daugiau nei sekundė.
Beje, pernai lygtinės laisvės atėmimo bausmės susilaukė ir jo treneris L. Horteris, kuris įkliuvo dėl finansinių machinacijų savo valdytame plaukimo klube.